[Mitarbeiter.zoologie] Fwd: [Job - Braunschweig] Wissenschaftliche/r Mitarbeiter/in - Scientist - Metabarcoding methods
Robert Paxton
robert.paxton at zoologie.uni-halle.de
Fr Mai 24 16:24:06 CEST 2019
Dear All,
An open position to follow the 12 PhD positions on wild bees, which probably confirms Antonella’s suspicion that a lot of wild bees (and their parasites/pathogens) are going to be slain in the name of conservation.
R
> Begin forwarded message:
>
> From: "DZG Aktuell" <dzg at zi.biologie.uni-muenchen.de>
> Subject: [Job - Braunschweig] Wissenschaftliche/r Mitarbeiter/in - Scientist - Metabarcoding methods
> Date: 24 May 2019 at 16:06:23 CEST
> To: "Prof. Dr. Robert Paxton" <robert.paxton at zoologie.uni-halle.de>
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> Stellenausschreibung [English version below]
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> Johann Heinrich von Thünen-Institut, Institut für Biodiversität
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> Wiss. Mitarbeiter/in /Scientist - Metabarcoding
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> Bewerbungsschluss: 15.06.2019
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> [Druckversion:https://www.dzg-ev.de/wp-content/uploads/2019/05/Wissenschaftliche-Mitarbeiter_Braunschweig2019.pdf <https://www.dzg-ev.de/wp-content/uploads/2019/05/Wissenschaftliche-Mitarbeiter_Braunschweig2019.pdf>]
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> Bekanntmachung von freien Stellen
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> Das Institut für Biodiversität des Johann Heinrich von Thünen-Institut, Bundesforschungsinstitut für Ländliche Räume, Wald und Fischerei, in Braunschweig sucht zum nächstmöglichen Zeitpunkt befristet für drei Jahre
>
> eine*n wissenschaftliche*n Mitarbeiter*in (w/m/d)
>
> für die (Weiter-)Entwicklung von Metabarcodingansätzen für die Analyse von Wildbienen und ihren Parasiten sowie Nistmaterial und Pollen.
>
> Die Forschungsarbeiten erfolgen im Rahmen des Projektes ‚Monitoring der biologischen Vielfalt in Agrarlandschaften‘ mit der Möglichkeit zur eigenen wissenschaftlichen Qualifizierung, z. B. mit dem Ziel, Leitungsaufgaben in molekularbiologischen Laboren in Forschungseinrichtungen des Bundes und der Länder zu übernehmen. Die Befristung des Arbeitsverhältnisses erfolgt nach § 2 Abs. 1 Satz 2 Wissenschaftszeitvertragsgesetz.
>
> Da Deutschland derzeit über keine umfassenden Daten zum Zustand und zur Entwicklung der Biodiversität in Agrarlandschaften verfügt, entwickelt ein interdisziplinäres Team von Wissenschaftlern aus 12 Fachinstituten des Thünen-Instituts und Julius-Kühn-Instituts sowie des Informations- und Koordinationszentrums für Biologische Vielfalt der Bundesanstalt für Landwirtschaft und Ernährung ein Agrarlandschafts-Monitoring (https://www.thuenen.de/de/bd/arbeitsbereiche/monitoring/).
>
> In Agrarlandschaften übernehmen Wildbienen wichtige Ökosystemleistungen wie Bestäubung und können darüber hinaus als Indikatoren für Landschaftsstrukturen und zur Bewertung von Agrarumweltmaßnahmen verwendet werden. Insbesondere Pollen und andere Einträge in Nisthilfen geben Aufschluss über die Auswirkungen von Landnutzung und z. B. Pestizidanwendungen auf Wildbienenpopulationen und damit auch auf Ökosystemfunktionen und -leistungen. Der Schwerpunkt der Stelle liegt auf der (Weiter-)Entwicklung von (eDNA-) Metabarcodingansätzen zur Bestimmung von Wildbienen und deren Parasiten sowie von Pollen und Nistmaterial. Diese Ansätze sollen in das Monitoring der biologischen Vielfalt in Agrarlandschaften integriert werden.
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> Aufgaben:
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> Prüfung und Entwicklung von molekularbiologischen Ansätzen zur Artbestimmung und Schätzung von Abundanzen (z. B. von Wildbienen, Pflanzen, Parasiten, Krankheitserreger) aus Nisthilfen:
> a) Entwicklung und Optimierung von Protokollen, Techniken und Workflows für Next Generation Sequencing (NGS) von Mischproben (Metabarcoding) in Abstimmung mit bereits existierenden Ansätzen
> b) Entwicklung quantitativer molekularbiologischer Ansätze zur Abundanzschätzung (qPCR
> Konzipieren und Anlegen von standardisiert erfassten Referenzdatensätzen zur Validierung der durch Metabarcoding gewonnenen Ergebnisse
> Austausch und Zusammenarbeit mit wissenschaftlichen Einrichtungen zur Nutzung des (eDNA-) Metabarcoding- und qPCR-Ansatzes in Monitoringprogrammen und Citizen Science-Projekten
> Publikationstätigkeit in internationalen und nationalen wissenschaftlichen Zeitschriften; Vortragstätigkeit
> Erforderliche Qualifikationen:
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> Abgeschlossenes Hochschulstudium (Univ.-Diplom, M.Sc.) in den Fachrichtungen Biologie, Umweltwissenschaften oder ähnlicher Fachdisziplinen mit Promotion
> Fundierte Kenntnisse in Next Generation Sequencing (NGS), qPCR und molekularen Methoden
> Sehr gute Kenntnisse in der Bioinformatik und multivariater Statistik
> Sehr gute Kenntnisse in R
> Erfahrungen in der Analyse von eDNA, wünschenswert im agrarökologischen Kontext
> Freude an der Methodenentwicklung
> Interesse an agrar-/umweltwissenschaftlichen Fragestellungen
> Selbständige Arbeitsweise, ausgeprägte Kooperations- und Teamfähigkeit
> Sehr gute Kommunikationsfähigkeiten
> Sehr gute Deutsch- und Englischkenntnisse in Wort und Schrift
> Weil uns die fachliche und persönliche Entwicklung unserer Mitarbeiterinnen und Mitarbeitern wichtig ist, bieten wir ein familienfreundliches Arbeitsumfeld, flexible Arbeitszeitmodelle und umfangreiche Angebote der fachlichen Aus-und Weiterbildung an.
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> Wir bieten Ihnen die Möglichkeit, in einem aktiven und stimulierenden Forschungsumfeld gesellschaftlich hochrelevante Fragestellungen an der Schnittstelle zwischen Wissenschaft und Praxis zu bearbeiten und dabei Kontakte zu nationalen und internationalen Forschungseinrichtungen sowie Organisationen zu nutzen. Weil uns die fachliche und persönliche Entwicklung unserer Mitarbeiterinnen und Mitarbeitern wichtig ist, bieten wir ein familienfreundliches Arbeitsumfeld, flexible Arbeitszeitmodelle und umfangreiche Angebote der fachlichen Aus-und Weiterbildung an.
>
> Das Arbeitsverhältnis richtet sich nach den Bestimmungen des Tarifvertrages für den öffentlichen Dienst (TVöD). Die Zahlung des Entgelts erfolgt bei Erfüllung der tariflichen Voraussetzungen nach Entgeltgruppe 13 TVöD. Teilzeitbeschäftigung ist grundsätzlich möglich.
>
> Das Thünen-Institut fördert die berufliche Gleichstellung von Frauen und Männern und begrüßt daher ausdrücklich die Bewerbung von Frauen.
> Das Thünen-Institut sieht sich der Inklusion verpflichtet. Bewerbungen von Menschen mit Schwerbehinderungen sind daher ausdrücklich erwünscht. Diese werden im Auswahlverfahren besonders berücksichtigt.
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> Fachliche Rückfragen sind bei Herrn Prof. Dr. J. Dauber (Tel.: 0531-596-2501) möglich.
>
> Bewerbungen mit tabellarischem Lebenslauf, Darstellung von Ausbildung und beruflichem Werdegang, Adressen für zwei Referenzen sowie Zeugniskopien werden bis zum 15.06.2019 unter Nennung der Kennziffer 19-163-BD elektronisch (als ein pdf-Dokument) erbeten an
>
> bd at thuenen.de <mailto:bd at thuenen.de>
> Johann Heinrich von Thünen-Institut Institut für Biodiversität
> Herrn Prof. Dr. Jens Dauber
> Bundesallee 65
> 38116 Braunschweig
>
> Informationen nach Artikel 13 DSGVO zur Erhebung personenbezogener Daten finden Sie unter https://www.thuenen.de/datenschutzhinweis-bewerbungen./ <https://www.thuenen.de/datenschutzhinweis-bewerbungen./>
>
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> [English version:https://www.dzg-ev.de/wp-content/uploads/2019/05/Scientist_Braunschweig2019.pdf <https://www.dzg-ev.de/wp-content/uploads/2019/05/Scientist_Braunschweig2019.pdf>]
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>
> The Institute of Biodiversity at the Johann Heinrich von Thünen-Institute, Federal Research Institute for Rural Areas, Forestry and Fisheries, in Braunschweig is offering a full-time position (currently 39 hours per week) for a
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> Scientist (m/f/d)
>
> for the development of metabarcoding methods to analyse wild bees and their parasites as well as trap nest material and pollen.
>
> The research is part of the collaborative project ‘Monitoring farmland biodiversity’. The position is limited to a fixed term, three (3) year employment in compliance with § 2 (1) S. 2 Wissenschaftszeitvertragsgesetz and is to be filled as soon as possible.
>
> To obtain a comprehensive assessment of the status and trends of biodiversity in agricultural landscapes in Germany, an interdisciplinary team of scientists from 12 specialized institutes of the Thünen- and the Julius- Kühn Institutes, as well as the Information and Coordination Centre for Biological Diversity of the Federal Agency for Agriculture and Food is developing a farmland biodiversity monitoring scheme (https://www.thuenen.de/en/bd/fields-of-activity/monitoring/).
>
> In agricultural landscapes, wild bees overtake important ecosystem services such as pollination. In addition, they can serve as indicators for landscape complexity and can be used for the evaluation of agri-environmental schemes. In particular, pollen and other environmental material in trap nests allow a detailed insight on the impact of land-use and pesticide applications on wild bee populations and therewith also on ecosystem functions and services.
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> The main task of the position is to develop molecular methods for the analysis of pollen and environmental material from trap nests and to integrate these approaches into the farmland biodiversity monitoring scheme.
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> Job description:
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> Design and implement molecular methods for the determination of species and estimation of species abundances (e.g. wild bees, plants, parasites, pathogens) from trap nests:
> a) develop and optimize protocols, techniques and workflows of Next Generation Sequencing (NGS) of mixed samples (metabarcoding) in accordance with existing approaches
> b) develop quantitative molecular methods for estimations of species abundances (qPCR)
> Validate molecular methods based on high-quality biodiversity data sets
> Design the integration of NGS and qPCR based methods to monitoring programmes and Citizen Science projects
> Publish and communicate results in scientific journals and at international and national conferences
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> Your profile:
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> PhD (or equivalent professional experience) in landscape ecology, agroecology, environmental science, biology, or a closely related field
> Experience with NGS methods, qPCR, and molecular methods
> Very good knowledge in bioinformatics and multivariate statistics
> Very good knowledge of R
> Experience in the analysis of pollen and other environmental samples, preferably in an agro-ecological context
> Interest in methods development
> Interest in agricultural and environmental topics
> Ability to work independently and strong capacity for interdisciplinary teamwork
> Strong communication skills
> Candidates should be fluent in English (written and spoken), German language skills are desirable
> We offer work in an active and stimulating scientific environment on questions of high relevance at the intersection between basic and applied life science and agriculture. The project promotes the collaboration and interaction with experts from national and international research organisations. The Thünen Institute offers a family-friendly environment, flexible working hours and the possibility for further training and qualification.
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> The employment is governed by the Wage Agreement for Public Services (TVöD-Bund) and includes comprehensive health, social, and pension insurances. The salary is according to category 13 TVöD. Part time employement is also possible.
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> The Thünen Institute promotes the professional equality of women and men and is thus especially interested in applications from women.
> Severely disabled applicants with equal qualification will be given particular consideration. Only a minimum physical aptitude is expected from them.
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> Please contact Prof. Dr. Jens Dauber (phone: +49 531 596 2501) for enquiries about the position.
> Applicants should submit a cover letter, curriculum vitae, and copies of relevant certificates in a single pdf file. Electronic submission is preferred. E-mail all application material (subject 19-163-BD) no later than 15.06.2019 to
>
> bd at thuenen.de <mailto:bd at thuenen.de>
> Johann Heinrich von Thünen-Institut Institut für Biodiversität
> Prof. Dr. Jens Dauber
> Bundesallee 65
> 38116 Braunschweig
> Germany
>
> Informations about Artikel 13 DSGVO: https://www.thuenen.de/datenschutzhinweis-bewerbungen./ <https://www.thuenen.de/datenschutzhinweis-bewerbungen./>
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> weitere aktuelle Stellenausschreibungen finden Sie auf der DZG- webpage:
> https://www.dzg-ev.de/stellenboerse/ <https://www.dzg-ev.de/stellenboerse/>
> wenn Sie keine Nachrichten mehr von uns wünschen, antworten Sie bitte mit "unsubscribe" im Betreff
> To unsubscribe and stop receiving emails from the German Zoological Society please reply with "unsubscribe" in the subject line
>
> posting date: 24.05.2019
>
> [Braunschweig] Johann Heinrich von Thünen-Institut, Institut für Biodiversität, Wissenschaftliche/r Mitarbeiter/in – Scientist – Metabarcoding methods. Bewerbungsschluss / Deadline: 15.06.2019, mehr…(.pdf) <https://www.dzg-ev.de/wp-content/uploads/2019/05/Wissenschaftliche-Mitarbeiter_Braunschweig2019.pdf> / more… (.pdf) <https://www.dzg-ev.de/wp-content/uploads/2019/05/Scientist_Braunschweig2019.pdf>
> [Hamburg] Centrum für Naturkunde – Cenak-, Universität Hamburg, 3 wiss. Mitarbeiter*innen-Stellen: 1. Kurator Ornithologie, 2. Kurator Entomologie (Mecopteroidea), 3. Kurator Entomologie (Neuropteriformia) / Centrum for Natural History – CeNak -, Universität Hamburg, 3 Research Associate Positions: 1. Curator Ornithology, 2. Curator of Entomology (Mecopteroidea: Lepidoptera, Trichoptera, etc.), 3. Curator of Entomology (Neuropteriformia: Coleoptera, Neuroptera, etc.). Application Deadline: 04.07.2019, mehr / more… (pdf1 <https://www.dzg-ev.de/wp-content/uploads/2019/05/wimi_1_Ornithologie_hamburg2019.pdf>/.pdf1EN <https://www.dzg-ev.de/wp-content/uploads/2019/05/wimi_1_Ornithology_hamburg2019_engl.pdf>), (pdf2 <https://www.dzg-ev.de/wp-content/uploads/2019/05/wimi_2_Mecopteroidea_hamburg2019.pdf>/.pdf2EN <https://www.dzg-ev.de/wp-content/uploads/2019/05/wimi_2_-Mecopteroidea_hamburg2019_engl.pdf>), (pdf3 <https://www.dzg-ev.de/wp-content/uploads/2019/05/wimi_3_Neuropteriformia_hamburg2019.pdf>/.pdf3EN <https://www.dzg-ev.de/wp-content/uploads/2019/05/wimi_3_Neuropteriformia_hamburg2019_engl.pdf>)
>
> posting date: 22.05.2019
> [Berlin] FU Berlin, Institute of Biology, Evolution and Ecology of Insect Defences group, PhD position: eco-evo-immunology of Drosophila – bacteria interactions. Application deadline: 10th June 2019, more… (.pdf) <https://www.dzg-ev.de/wp-content/uploads/2019/05/phd_berlin2019b.pdf>
> [Berlin] Bundesinstitut für Risikobewertung (BfR), wiss. Mitarbeiter/in – Statistik. Bewerbungsschluss: 11.06.2019, mehr… (.pdf) <https://www.dzg-ev.de/wp-content/uploads/2019/05/statistiker_berlin2019.pdf>
> posting date: 20.05.2019
>
> [Salzburg] University of Salzburg, Department of Biosciences, Evolutionary Zoology Group. 6-years postdoc position in Evolutionary Zoology: Environmental stress – rapid adaptation to regional environmental changes. Deadline: 12.06.2019, more…. (.pdf) <https://www.dzg-ev.de/wp-content/uploads/2019/05/PostDoc-Salzburg2019.pdf>
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